Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1CQ92928 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB1CQ92928 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB1CQ92928 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms