Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms