Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL3Q8TAT5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL3Q8TAT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL3Q8TAT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL3Q8TAT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEIL3Q8TAT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL3Q8TAT5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL3Q8TAT5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL3Q8TAT5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms