Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4YQ8NFZ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4YQ8NFZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4YQ8NFZ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4YQ8NFZ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4YQ8NFZ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4YQ8NFZ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms