Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf52Q8N6N3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf52Q8N6N3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms