Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRACR2BQ8N4Y2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRACR2BQ8N4Y2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CRACR2BQ8N4Y2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms