Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC82Q8N4S0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC82Q8N4S0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC82Q8N4S0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC82Q8N4S0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms