Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STAG2Q8N3U4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STAG2Q8N3U4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STAG2Q8N3U4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms