Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC13Q8IYE1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC13Q8IYE1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms