Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD2Q8IXW0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNTD2Q8IXW0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms