Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf40Q8IXQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf40Q8IXQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf40Q8IXQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms