Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRSK2Q8IWQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRSK2Q8IWQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRSK2Q8IWQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRSK2Q8IWQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.3 ms