Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TXNDC2Q86VQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TXNDC2Q86VQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TXNDC2Q86VQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TXNDC2Q86VQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TXNDC2Q86VQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms