Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAINQ86UA6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAINQ86UA6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms