Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00523Q86TU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00523Q86TU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms