Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCQ7RTU9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
STRCQ7RTU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
STRCQ7RTU9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
STRCQ7RTU9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 885.3 ms