Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCXQ7RTU7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms