Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SV2BQ7L1I2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SV2BQ7L1I2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms