Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP31Q70CQ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
USP31Q70CQ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
USP31Q70CQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP31Q70CQ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms