Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFXL1Q6ZNB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFXL1Q6ZNB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms