Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM220Q6QAJ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms