Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD4Q6IC98 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRAMD4Q6IC98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms