Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RSBN1Q5VWQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RSBN1Q5VWQ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms