Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BROXQ5VW32 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms