Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf146Q5VVC0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf146Q5VVC0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf146Q5VVC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf146Q5VVC0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf146Q5VVC0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf146Q5VVC0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms