Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDHAF4Q5VUM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDHAF4Q5VUM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHAF4Q5VUM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms