Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR78Q5VTH9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
WDR78Q5VTH9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR78Q5VTH9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms