Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOGA3Q5TF21 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SOGA3Q5TF21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SOGA3Q5TF21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms