Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4BQ5PRF9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4BQ5PRF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4BQ5PRF9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms