Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC158Q5M9N0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC158Q5M9N0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms