Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLEC12Q5KU26 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLEC12Q5KU26 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COLEC12Q5KU26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COLEC12Q5KU26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms