Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTH9

RRP12, RRP12-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP12Q5JTH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP12Q5JTH9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP12Q5JTH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP12Q5JTH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP12Q5JTH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP12Q5JTH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms