Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD12Q587J7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD12Q587J7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms