Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUSP28Q4G0W2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP28Q4G0W2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms