Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF3Q3KNV8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms