Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3C1V9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3C1V9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3C1V9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3C1V9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3C1V9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3C1V9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3C1V9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3C1V9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3C1V9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3C1V9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3C1V9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3C1V9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3C1V9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q3C1V9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q3C1V9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q3C1V9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3C1V9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q3C1V9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3C1V9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3C1V9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3C1V9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3C1V9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q3C1V9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q3C1V9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3C1V9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3C1V9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3C1V9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3C1V9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3C1V9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q3C1V9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q3C1V9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3C1V9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3C1V9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3C1V9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3C1V9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3C1V9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3C1V9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3C1V9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3C1V9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3C1V9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3C1V9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3C1V9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3C1V9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3C1V9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3C1V9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3C1V9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3C1V9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3C1V9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3C1V9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3C1V9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3C1V9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms