Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTU2Q2VPK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTU2Q2VPK5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU2Q2VPK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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