Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP5B1Q2VPB7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP5B1Q2VPB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP5B1Q2VPB7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms