Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL40Q2TBA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL40Q2TBA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms