Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FSCN1Q16658 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSCN1Q16658 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FSCN1Q16658 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN1Q16658 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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