Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTF1Q16619 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTF1Q16619 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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