Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TNXAQ16473 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNXAQ16473 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TNXAQ16473 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNXAQ16473 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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