Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPEGQ15772 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPEGQ15772 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEGQ15772 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEGQ15772 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms