Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRKQ15262 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRKQ15262 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRKQ15262 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
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