Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HDM1Q15032 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
R3HDM1Q15032 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
R3HDM1Q15032 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
R3HDM1Q15032 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
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