Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS1Q14651 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLS1Q14651 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLS1Q14651 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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