Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTCH1Q13635 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTCH1Q13635 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTCH1Q13635 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTCH1Q13635 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
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