Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF5Q13243 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF5Q13243 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF5Q13243 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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