Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALCOCO2Q13137 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO2Q13137 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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