Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTP4A2Q12974 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTP4A2Q12974 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTP4A2Q12974 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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